重庆医科大学附属儿童医院于1956年由上海医学院儿科系迁渝创建，是集医教研为一体的国家三级甲等综合性儿童专科医院、是《中华儿科杂志》主编、《中华小儿外科杂志》和《儿童保健学》杂志副主编和全国儿科学统编教材主编、副主编单位，是中华医学会围产医学分会副主任委员，中华医学会儿科学分会免疫学组组长、全国肿瘤学组组长和中华医学会儿科学分会神经病学组、药学组、急救学组、儿童保健学组、泌尿学组副组长单位。曾两次被评为全国卫生系统先进集体、全国精神文明建设工作先进单位和获全国青年文明号称号。
医院专业设置齐全，是重庆市哮喘防治中心、激光应用中心、危重新生儿及早产儿急救中心。共有28个临床和医技科室，主要专业涉及儿内科、儿外科、感染消化科、急诊科、耳鼻喉科、眼科、心理科等。其中儿童免疫缺陷病、脑电生理、外周神经疾病、白血病与实体肿瘤、营养与生长发育、过敏性疾病诊治在全国享有盛誉。儿科学院承担着儿科医学、护理学各层次学生及进修生等教学任务，每年在读硕、博士研究生近200名，进修生100余名；医院实行住院医师、临床护士、医技、管理人员规范化培训，是卫生部指定的儿科医学生毕业后培训基地之一。